纳米孔测序技术结合元基因组分析 新法可快速检测埃博拉病毒

科技日报北京9月30日电  （记者刘岁晗）美国研究人员近日完成的一项原则证明性研究称，基于DNA排序的实时血液检测，可迅速对埃博拉出血热、基孔肯雅热等危重传染病进行诊断。研究人员表示这项检测未来有望用于实验场地和医疗设施缺乏的地区。

大多数商用或科研用基因诊断是以特定的病原体为目标。但美国加州大学旧金山分校检验医学副教授查尔斯·邱（音译）领导的研究团队开发出的新检测技术，则不要求预先识别出嫌疑病原体。这种在临床所有DNA样本中不知道哪种是正在被拿来检测的公正无预判的分析手段，被称为元基因组分析法，已用于对埃博拉病毒的检测。

去年，运用这种方法，该研究团队检测了一名来自威斯康星州患有严重脑炎的男孩脊髓液中的所有DNA样本，诊断出了一种罕见的病毒，在医学界引起了强烈反响。但当时诊断费时两天。此次，研究团队对两位来自非洲的埃博拉患者储存血液样本中的遗传指纹进行检测。整个诊断过程持续五小时，而DNA测序本身才花费了10分钟。在本次检测中，研究人员开发了可在笔记本上使用的分析和可视化软件，并利用了新兴的DNA测序技术——纳米孔测序技术来辅助实验，大大提高了获取实验结果的速度。

纳米孔测序技术是DNA第四代最先进的测序技术。该技术通过测量对不同核酸通过纳米孔时对电流产生的微弱扰动差异，来识别不同碱基。纳米孔测序装置不仅体积小，携带方便，还可以实时、直接生成实验数据，使基因测序过程变得迅速了许多。

研究团队还检测了波多黎各正在暴发的基孔肯雅热的致病病毒。他们从一位并未表现出任何症状的当地献血者的血液样本中迅速检测到了基孔肯雅病毒，该献血者最终报告发烧并伴有关节疼痛。

查尔斯·邱指出，将纳米孔测序技术运用于实时元基因组检测病原体的方法，将为传染病诊断带来根本上的改变。